Про запекание янтаря в хлебе не слышал. Знаю о том, что в хлебе запекали дымчатый кварц (раухтопаз). После этого у камней уходила дымчатая окраска и появлялся более выраженный жёлто-красноватый оттенок. Такие камни становились более похожи на цитрин и стоили дороже.
Если подобное проделывали с янтарём, то предположу, что с той же целью (хотя понятно, что янтарь - это ни разу не кварц): изменение окраски и, как следствие, увеличение в цене.