Контроль водно-солевого баланса и выделение определённых продуктов метаболизма почками и переваривание и впитывание воды и веществ из пищи – это разные системы, эволюционное разделение которых повысило эффективность обмена веществ. У позвоночных животных пища переваривается и питательные вещества всасываются не только в желудке, но и в большей части кишечника (в некоторых отделах при участи симбиотических бактерий). Если сбрасывать мочу в кишечник (в вышележащие его отделы), то, с учётом свойств мочи и частоты процесса её вывода из организма (вывод каловых масс осуществляется гораздо реже), будет нарушен весь процесс допереваривания пищи, всасывания микроэлементов и витаминов, будет уничтожена симбиотическая микрофлора, нарушится вывод веществ, которые выводятся через кишечник, а свойства эпителия некоторых отделов кишечника должны будут измениться (стать как у мочевого пузыря).
При этом нет проблем в объединении
выходов мочеиспускательного канала, половых протоков и отверстия для вывода кала, что мы наблюдаем у многих животных в форме
клоаки. Это позволяет иметь упрощённый мочевой пузырь или вовсе от него отказаться (как у птиц). Т.к. клоака является, по сути, расширенной конечной частью кишки, то можно сказать, что у некоторых животных и каловые массы, и жидкости уходят через кишечник, но только через его финальный очень короткий участок.
Почему эволюция большинства млекопитающих пошла по пути оконечного разделения мочеполовых путей и анального отверстия – вопрос открытый. Клоака есть у яйцекладущих млекопитающих, а из плацентарных только у отряда афросорициды. Возможно, что для репродуктивной системы млекопитающих оказалось выгоднее отделить половые пути от переполненных бактериями каловых масс, что уменьшило вероятность распространения инфекций на эмбриона и плода при живорождении.