Для однородности вкуса. Например сок с мякотью со временем расслаивается и мякоть либо, оседает либо поднимается. Также у некоторых напитков есть определённые наполнители, которые тоже должны равномерно распределился по жидкости.
А вот газированные напитки встряхивать нельзя.