Нужно создать резервную копию айфона через iTunes и восстановить из резервной копии его опять. Тогда удалится всё лишнее, но останется вс ё нужное.
Возможно у вас заполнено резервное хранилище всякими устаревшими копиями,должна помочь очистка icloud и создание новой(одной) резервной копии,если не справитесь - обращайтесь ,поможем