Короткий ответ - да, можно, но это вряд-ли будет та экосистема, которая радует вас своим видом.
Чаще всего баланс скатывается к биоценозу бактерий, нитчатых водорослей и нематод, попросту говоря - это будет аквариум с тухлой водой и тиной - но это тоже экосистема.
Если же пробовать создать баланс на более интересных видах, то ключевым условием здесь будет стабильность внешних факторов - поступления энергии (через освещение) и температуры. Стабильность может подразумевать колебания (чередования дня и ночи), но они тоже должны быть регулярными. Иначе эта игра будет напоминать строительство карточного домика в автобусе, едущем по ухабистой дороге. Далее, в природных экосистемах на одну красивую рыбку приходится гораздо больше растений, микроорганизмов и беспозвоночных животных, нежели мы привикли видеть в обычных аквариумах. Поэтому создание самодостаточного аквариума дейтствительно (как указывали здесь другие эксперты) должно идти от нижних этажей экологической пирамиды и с примерным соблюдением её пропорций.