Вопросы, которые задают Алисе, попадают ли в общее число запросов поиска в статистике от Яндекса?

Добрый день!

Да, вы правы. Голосовые запросы, также как и текстовые, попадают в общую статистику по запросам. В Яндекс.Вордстат, например, вы можете сами в этом убедиться.