При подключении телефона к компьютеру, есть возможность выбрать тип подключения. Выбираете поочередно каждый. У меня при одном типе не отображались все видео, а при другом они появились и я смог сбросить их на компьютер и отредактировать.
Отыскать скрытые файлы можно сторонним Диспетчером файлов. В Маркете их множество.
Если же хотите почистить место, но не хотите удалять - используйте Яндекс.Диск, Google Disk и другие облачные хранилища.
Какие именно приложения чистить?