Все зависит от того, на кого хотите поступать, что вообще в будещем хотите делать. Есть направления, после окончания которых можно успешно работать только в больших городах, а есть специальности, которые нужны только в определенных регионах (например, инженерные специальности, химические, связанные с добывающей отраслью, металлургией и др.). Престижность вуза, конечно, также влияет на успешное трудоустройство в будущем. Если сдали ЕГЭ хорошо и есть возможность поступать в вузы мегаполисов, то выбирайте их. В дальнейшем всегда можно вернуться в родной город. Можно бакалавриат окончить в своем городе, а магистратуру в крупном. Посмотрите, какие есть варианты. Вот тут можно оценить свои шансы поступления в разные вузы на разные программы. Личная активность также очень важна, если будете стремиться к развитию, изучению нового, получать опыт участия в разных мероприятих, конкурсах, стажировках, практиках, станете ценным специалистом, то работодателю будет не сильно важно, какой вуз вы окончили.