Вы задали вопрос, который требует очень подробного рассмотрения. Для начала, был ли, как вы выражаетесь, между германскими вооружёнными силами и СС раскол? Его не было, т.к. раскол - это ситуация, когда некая единая общность внезапно оказывается необратимо разделённой на несколько противоположных. Ввиду того, что единства между немецкой армией и СС никогда не было, то и раскола между ними не происходило. Взаимоотношения между ними с момента вступления А. Гитлера на должность рейхсканцлера Германского рейха были абсолютно другими - это были взаимная отчуждённость, взаимное недоверие и вынужденное сотрудничество. При этом важно учитывать множество условий, требующихся для объяснения действительной картины взаимоотношений между СС и вооружёнными силами:
Ответ будет длинным даже без углубления в подробности и предпосылки тех или иных ситуаций и процессов, за разъяснением каждого отдельного тезиса следует смотреть соответствующую литературу.
С момента установления в Германии республиканского режима германские вооружённые силы - рейхсвер - находились в обособленном относительно республиканского правительства и общества положении. Объявив себя "вне политики", германские ВС были оплотом немецкого консерватизма, враждебного парламентскому строю и видящими идеалом государственного строя Германии внепарламентскую монархическую или военную диктатуру. Когда на политической сцене Германии появилась НСДАП, отношение армейской верхушки к ней было в целом отрицательным, но с рядом оговорок, исключений и противоречий. Со своей стороны лидер этой партии Адольф Гитлер, избрав для себя стратегию "легального" (я не буду уходить в сторону, объясняя эту "легальность" - скажу лишь, что легальным приход к власти Гитлера назвать абсолютно невозможно, несмотря на формальные признаки этой легальности, обманывающие стороннего наблюдателя) прихода к власти, одним из важнейших условий считал достижение договорённостей о поддержке с важнейшими государственными институтами - армией, государственным аппаратом, бизнесом. Несмотря на то, что армейское командование отрицательно относилось к Гитлеру и НСДАП, оно достигло с новым канцлером соглашения. В обмен на поддержку армии, Гитлер обещал следующее:
СА были не единственной парамилитарной организацией НСДАП - другой такой организацией были СС, отличавшиеся безоговорочным подчинением А. Гитлеру. Амбиции молодого лидера этой организации рейхсфюрера СС Генриха Гиммлера лежали в иной плоскости - СС были созданы как подразделения личной охраны вождей партии, затем в ней появилась служба безопасности рейхсфюрера СС (СД), которая занялась борьбой с врагами НСДАП и её лидеров. С момента же прихода нацистов к власти СС стремились стать службой безопасности не только партии, но и всего германского государства, объединив в единое суперведомство все структуры германской полиции и СД (несмотря на то, что Г. Гиммлеру в результате стала подконтрольной вся немецкая полиция, от сельской жандармерии до тайной полиции, этого так и не удалось достичь). Но и амбиции военного лидера у главы СС были - поэтому на базе сначала личной охраны фюрера, охраны концентрационных лагерей и некоторых других подразделений организации начали создаваться военизированные отряды - соответственно "Лейбштандарт СС Адольф Гитлер", конвойные войска охраны концентрационных лагерей "отряды Мёртвая голова" и т.наз. "части усиления СС" (в итоговом виде представлявшие собой три пехотных полка и несколько отдельных батальонов - разведывательный, сапёрный, связи и т.д.), которые проходили боевую подготовку под руководством бывших армейских офицеров (оказавшихся новаторами в деле военного обучения и создания новой тактики пехотного боя). Разумеется, эти претензии Гиммлера и создание таких частей было воспринято армией как нарушение данного Гитлером слова. Это стало причиной открытой напряжённости в отношениях между армией и СС и ряда компромиссов, в которых армия последовательно (особенно в ходе войны) уступала свои позиции.
Другим важным процессом развития взаимоотношений СС и армии (в которой так же армия теряла свои позиции) было развитие оппозиционной деятельности ряда немецких офицеров с одной стороны, усиление роли служб безопасности под контролем СС и их вторжение в сферу компетенции армии с другой и усиление роли СС и лично Гиммлера в германском государстве и строительстве вооружённых сил - с третьей. В своём отношении к Гитлеру лично, НСДАП и его политике в армейской среде наблюдалось три тенденции - одна часть генералов Гитлера безоговорочно поддержала, другая хотя и не выражала искреннего согласия, но подчинилась ему как главе государства, которому они принесли присягу, третья часть ушла в явную или тайную оппозицию (но не всё так просто - ситуация менялась, одни сегодня могли готовить свержение Гитлера, а завтра - с радостью готовить военные планы, другие - сегодня восторженно поддержать, а завтра мечтать убить). Со временем в командовании сухопутных войск (флот и ВВС были на протяжении всей нацистской истории полностью лояльны Гитлеру) сложилось несколько центров более или менее активного сопротивления агрессивной политики Гитлера - в Генеральном штабе, во фронтовом командовании, в армии резерва (командовании войсками на территории рейха), в военной разведке (то, что мы называем абвером). Со временем друг на друга наложилось несколько факторов. Во-первых, после первоначальных успехов немецкая армия всё чаще начала испытывать трудности, начались первые поражения, и постепенно у Гитлера возникло стойкое недоверие к армейской верхушке, инициатива, права и возможности которой всё более ограничивались. Во-вторых, неожиданно для всех хорошо показали себя те самые военизированные части СС, которые так раздражали генералов (в результате между фронтовыми частями армии и войсками СС установились отношения вполне искреннего сотрудничества, что отмечалось и армейскими генералами, и отдельными военнослужащими). В-третьих, после ряда чувствительных провалов и нескольких раскрытых "предательских" дел подвергается аресту руководство военной разведки, а сама она в итоге интегрируется в РСХА. В-четвёртых, после неудачного покушения на Гитлера 20 июня 1944 года СС начинает репрессии против заподозренных в заговоре генералов и офицеров, армия переводится под плотный контроль партии (усиливается "национал-социалистическое воспитание", воинское приветствие заменяется нацистским и т.д.). Армия резерва (отдельное от фронтового армейское командование, которым подчинялись войска в самом рейхе, а не на фронте, и которое занималось набором и пополнением действующей армии), которая и была мозговым центром покушения и последовавшего за ним мятежа военных, была отдана под контроль главе СС Гиммлеру (который, помимо командования Армией резерва в разное время руководил немецкими войсковыми объединениями - группами армий).
И последнее, о чём я напишу - это отчасти связано уже с послевоенной "войной памяти", но началось ещё в самом начале Второй мировой войны. Дело в том, что Гитлер вёл не просто войну, а расовую войну, предусматривавшую не только создание "жизненного пространства для немецкого народа на востоке", но и возрождение и укрепление на этой территории арийской расы. И он эту войну вёл фактически под лозунгом "должен остаться только один" (т.е. сильнейший должен выжить, а побеждённый - погибнуть; в конце войны он говорил в этом же ключе о немецком народе: дескать, он проиграл, следовательно должен исчезнуть). Одной из составляющих этой расовой войны было использование специальных подразделений, которые часто именуют "эскадронами смерти" - "оперативные группы СД и полиции безопасности", или айнзац-группы. Целью их было физическое истребление "врагов рейха" - "враждебных" расовых (евреи, цыгане) и социальных (интеллигенция, офицерство побеждённых армий, духовенство) групп завоёванных государств. И если во время польской кампании 1939 года эта деятельность и встретила активные протесты армейского командования, то перед началом войны с СССР между СС и вермахтом уже было достигнуто соглашение о беспрепятственном действии в армейском тылу этих подразделений и содействии со стороны армии. В ходе войны армейское командование в лучшем случае пыталось робко протестовать, но потом окончательно приняло эти условия, а в обычных - активно содействовало убийцам. Потом, уже после войны, германские генералы и офицеры начали активно воздействовать на общественное мнение (они писали книги, мемуары, статьи, работали на американское правительство, которому запудрило мозги), в результате чего было сформирован очень стойкий (а именно в России - до сих пор) нарратив: мы, армия, всё сделали правильно, мы воевали согласно законам и обычаям войны, мы не совершали никаких преступлений, мы последовательно выступали против политики и стратегии Гитлера, и если бы он не мешал, мы бы выиграли войну. Но кто совершал все те преступления, которые были известны всему миру? Ответ был дан - СС, т.е. взаимная неприязнь и неприятие друг друга продолжились и после войны. Что любопытно, часть бывших эсэсовцев приняли правила игры - командиры войск СС ведь тоже писали мемуары, издавали газеты и журналы, имели свои организации. Их точка зрения наиболее ярко выражена в названии мемуаров одного из высших командиров войск СС Пауля Хауссера - их второе издание было названо "Солдаты, как все остальные". Он и другие мемуаристы фронтовых частей СС объявляли себя такими же, как и военнослужащие германской и всех прочих армий, они так же воевали согласно всем законам и конвенциям, а преступления совершали те члены СС, которые служили в СД и гестапо, охранники концлагерей, "запятнавшие" своими поступками честь мундира чинов войск СС.
Но постепенно историческое сообщество (а пионерами в этом деле стали именно немецкие историки) развенчало этот миф - и немецкая армия, и СС в совокупности несут равную ответственность за все преступления, совершённые немцами во время войны. Армия охотно участвовала в акциях массового истребления под руководством СС и сама их организовывала, на совести армии сотни сожжённых деревень и миллионы убитых гражданских лиц (в том числе евреев), на совести армии гибель миллионов (точнее, 3,5 миллионов) советских военнопленных от нечеловеческих условий содержания. Таким образом, итогом всех этих противоречивых и неприязненных (а порой враждебных) отношений между СС и немецкими вооружёнными силами стало равное участие в преступлениях и несмываемое пятно позора и проклятия человечества.
P.S. При необходимости раскрытия отдельных тезисов задавайте вопросы в комментариях.