Тут видимо проблема в определении, что называть всемирным потопом. Не думаю, что какие-то серьезные ученые утверждают, что был единовременный глобальный потоп.
Но есть минимум две пачки вполне научных соображений:
Разные народы и территории в своей истории переживали масштабные наводнения. Легенды о таких наводнениях оказывались в ходу у самых разных народов и в итоге дали почву мифу о всемирном потопе.
Можно в этом смысле утверждать, что он действительно был всемирным, просто не единовременным.
Геологические данные говорят, что огромные территории, являющиеся сейчас сушей, имеют слои морских отложений. Это также можно поэтически называть всемирным потопом, хотя он и был растянут во времени вообще на многие миллионы лет.