прописан в ком.квартире, но не проживаю в ней. Справку об этом в ЖКХ не принимают, так как нет счетчиков на воду. Как быть?

Скорее всего, Вы не правильно сформулировали вопрос. Какую справку вы имеете ввиду? Может быть не справку, а заявление? И при чем здесь счетчики? Если Вы имеете ввиду оплату за водоснабжение, то без счетчиков будете платить по нормативу, не зависимо от того проживаете или нет, это законно.