Бывает, что синтетические камни используются в качестве имитаций других камней, т.е. имитирующих только внешний вид, тогда это значит, что они заведомо отличаются своими химическими и физическими параметрами от имитируемых. Как, например, синяя синтетическая шпинель может имитировать натуральный, хотя и облагороженный, синий топаз. Или синтетический сапфир с эффектом смены цвета может плохо, но всё же имитировать натуральный редкий александрит.
А бывают синтетические камни как синтетический александрит, синт.кварц, синт.рубин, синт.сапфир, синт.бриллиант - такие практически совпадают по хим. и физ. параметрам с натуральными.
Собственно, основные различия между натуральными и синтетическими - это эмоции и редкость.
Синтетику выращивают люди, это вполне наука, часть геммологии, но это промышленные производства.
А натуральные камни формируются миллионами лет в разных слоях нашей планеты, потом это месторождение должны обнаружить, а сам камень добыть. Более того, чем крупнее и чем насыщеннее камень, тем и реже он встречается в природе, т.е. их число ограничено.