Вы, вероятно, имеете в виду "длинный" вариант таблицы. В этом варианте d-элементы помещены по горизонтали между s- и р-элементами, что соответствует порядку заполнения орбиталей в старших периодах. В первых трех периодах при этом получается дырка, поскольку заполнение первой d-орбитали (3d) начинается только у элементов четвертого периода. Это вопрос энергии орбиталей, не суть важно для вопроса, почему это происходит у элементов 4-го периода, хотя орбиталь 3d.
Но с точки зрения количества протонов/электронов в ядре, никакой дырки нет, то есть, у каждого следующего атома на 1 электрон/протон больше, чем у предыдущего, поэтому никаких новых элементов не будет, меньше одного электрона/протона прибавить нельзя. Дырка появляется только за тем, чтобы графически отразить последовательность заполнения орбиталей.
еще про дырку между водородом и гелием надо сказать)