РС 1782 года — в деревне есть семья, а вот в исповедках 1783, 1788 и 1799 годов её нет. С чем это может быть связано?

Это может быть связано с переселением семьи в другую местность. Вы просматривали ИВ и РС с 1782 по 1799 за каждый год или выборочно? Поищите документы о переселении.