У меня стоит Chrome на основном и другой ChromePortable на другом диске.
Иногда бывает так, что при заходе в Chrome на основном все сбрасывается и проходится заходить заново.
При этом синхронизации снова все восстанавливается. Но этом нужно в аккаунт заходить, подтверждать. Куда копать, чтобы ничего не сбрасывалось.
Mozilla стоит не требует синхронизации.