Продаю участок, полученный от РФ через выкуп, продаю дороже кадастровой стоимости. Владею менее 3-х лет. Необходимо ли платить налог 13%?

Налог есть, но его можно уменьшить. Бывает, и до ноля.

1). Отнимите от цены (пока предполагаемой) по договору купли продажи ваши расходы по приобретению.

2). Отнимите от той же цены 1 млн руб.

Способ можно выбрать только один – тот, который вам выгоднее, конечно.

Кадастровая стоимость имеет значение только в том случае, когда цена продажи меньше 70% от неё. Этот случай – не ваш.