Приветствую!
Смысл ставить новую поршневую скорее всего есть, иначе Вы бы не стали разбирать движок. Другое дело, что именно эту описанную Вами поршневую ставить я бы не советовал. Лучше обменять в магазине на комплект поршней с выемками под клапана, так называемые "безвтыковые". Но, справедливости ради замечу, что Вы не сказали о каком двигателе идет речь. Вполне возможно, что на Вашем двигателе клапана не встречаются с поршнями, и тогда получается, что разницы нет какие поршни ставить.