Да, суд будет принимать это в расчет.
Например, при разделе имущества.
В силу ч. 2 ст. 39 СК РФ Суд вправе отступить от начала равенства долей супругов в их общем имуществе исходя из интересов несовершеннолетних детей и (или) исходя из заслуживающего внимания интереса одного из супругов.
Согласно судебной практики, здоровье несовершеннолтених детей порой учитывается.