При смене кпп, необходимо перепрошивать соответствующие программы(програмное обеспечение).Затем проверьте датчики холостого хода. Всё это делается это с помощью компьютера. Смотрите в программе, где возникает ошибка и устраняете её.
Если самостоятельно разобраться трудно, то обратитесь в сервисный центр.