Наиболее вероятная причина болей это перегрузка хряща или связки надколенника. Как правило такая беда получается при недостаточной разминке или (и) когда пренебрегают упражнениями на растяжку четырехглавой мышцы. Мышца забивается, укорачивается, и нагрузка на хрящ и связку надколенника увеличивается. Появляется боль, в случае повреждения связки обычно локализуется выше или ниже надколенника, в месте перехода сухожилия в кость. В случае повреждения хряща, боль локализуется под чашечкой, часто сопровождается хрустом при попытке подвигать надколенник. Боль при повреждении надколенника обычно сильнее при подъеме по лестнице, чем при спуске, если больше болит при спуске, это чаще повреждение мениска.
В любом случае лучше обратиться к специалисту ортопеду, и разобраться в причине боли. Не советую пренебрегать сигналами которые вам дает ваш сустав.
Перенагрузка скорее всего. Дайте отдохнуть коленям и все пройдет. Если нет - это повод обратиться к врачам за диагностикой и консультацией колен.