Автоматически авторизироваться (выполнять вход, заполнять логин и пароль) ярлыки на рабочем столе не умеют. Но в них можно указать ссылку на Яндекс.Почту, чтобы в пару кликов переходить сразу к нужной странице. Если у вас не настроена очистка файлов cookies и вход в почту был выполнен однажды, авторизация произойдет автоматически и ничего заполнять не придется.
Для создания ярлыка на рабочем столе в любом месте нажмите правую кнопку мыши и выберите пункт меню Создать -> Ярлык. В открывшемся окне укажите путь до объекта https://mail.yandex.ru/ и после нажатия кнопки далее назовите ярлык по своему усмотрению.