Если я правильно понял вопрос, суд наложил арест на автомобиль "на всякий случай", т.к. этот а/м не имеет отношение к обвиняемому по этому делу. Т.е. арест был установлен как обеспечительная мера. И очевидно, приговором должно быть установлено это обстоятельство, что а/м отношение к обвиняемому не имеет. И если приговор этот вступил в законную силу, надо решать вопрос об отмене наложенного ареста на а/м. Отменить этот арест может суд, установивший его.
Следовательно для разрешения вопроса о регистрации, требуется обратиться в суд с заявлением об отмене обеспечительных мер в виде ареста на а/м.
Если это всё так, то проблема разрешится достаточно просто.
Остались вопросы обращайтесь, поможем даже онлайн