Вопрос на кандидатскую.)
Согласно ГПК РФ (для примера), все вопросы, связанные с оплатой экспертизы, подлежат разрешению судом в определении о её назначении (ч. 1 ст. 80), в основном или в дополнительном решении суда (ч. 5 ст. 198 и п. 3 ч. 1 ст. 201). При этом предусмотрено только три варианта распределения судебных расходов, в том числе на производство судебной экспертизы: 1 - стороной, заявившей соответствующую просьбу, 2 - обеими сторонами, 3 - за счёт средств соответствующих бюджетов (ст. 96 и 98). Если при разрешении дела вопрос о судебных расходах, связанных с производством судебной экспертизы, не был разрешён, следует подать заявление по вопросу судебных расходов в суд первой инстанции в течение 3 месяцев со дня вступления в законную силу судебного акта, которым завершилось рассмотрение дела (ст. 103-1).
Вариантов, предусматривающих отказ в оплате выполненной экспертизы в связи с её признанием недопустимым доказательством, в ГПК РФ нет.
Но это все касается именно судебной экспертизы, назначенной судом и выполненной в процессе рассмотрения дела.
Все, что касается различных досудебных и внесудебных вариантов "экспертиз", заказанных и оплаченных сторонами по собственной инициативе и потом отвергнутых судом в связи с их недопустимостью, нужно руководствоваться договорами об их производстве - имеются ли в них соответствующие условия оплаты договора.