Во время дождя меньше атмосферное давление и выше влажность (это метеорология). Эти два фактора уменьшают парциальное давление кислорода в составе воздуха (это физика), что и вызывает сонливость (это медицина).
Первобытный инстинкт. В дождь не охотятся крупные хищники, можно хоть немного расслабится. Да и пасмурное небо располагает к отдыху. Пошёл дождь - не страшна засуха, будет урожай. Это тоже влиянием уровень стресса