Почему вакуум, которого нет, называют истинным, а вакуум, который есть — ложным? Не логичнее ли наоборот?

Логика тут такая. Вакуум - это состояние физического поля с наименьшей энергией. Наблюдаемый вакуум ложный, потому что его энергия может оказаться локальным минимумом, а не глобальным.

Следовательно, этот вакуум плохой, негодный. Ложный.