Теперь в это трудно поверить, но чередование возникло потому, что нашим далеким предкам было трудно сказать "рука-руКенька" и "нога-ноГенька", и они вынуждены были говорить "руЧенька" и "ноЖенька".
Кстати, итальянцы , чтобы не заморачиваться с трудным для них произношением, сильно упростили очень многие европейский слова: адвокат - avvocato, Александрия - Alessandria, и т.п.