Эти поисковые системы по-разному оценивают один и тот же сайт, самостоятельно определяя, какие страницы заслуживают внимания. Небольшая разница в количестве страниц (до 10%) не критична, а вот если она велика, то стоит провести аудит сайта на предмет поиска критических ошибок: возможно, это результат серьезных недочетов на сайте.
Рекомендую проверить страницы в выдаче у гугла и яндекса. Часто из за неправильной работы CMS в индекс добавляются различные дубли, битые страницы и прочее...
Это важный фактор ранжирование страниц!
Потому что это разные поисковые системы разных стран.
Разные поисковые алгоритмы.
Разная "ценность" страниц
Разная скорость обхода сайта.
Разная скорость обработки и выдачи страниц в поиск.