Ирина, здравствуйте!
Ствол может темнеть от недостатка Кальция. Причин дефицита кальция может быть несколько.
1) Передозировка азотными удобрениями. Переизбыток одних питательных элементов в растении, закрывает доступ другим элементам.
2) Повышенная кислотность почвы. При низком уровне PH большинство питательных элементов крайне плохо усваиваются или не усваиваются совсем. Вообще, уровень PH или кислотность почвы - это один из важнейших показателей. На мой взгляд, большую часть проблем с растением стоит начинать решать с замера PH почвы. Это можно сделать химическим или электронным PH - тестом.
Если проблема в этом, то нужно просто раскислить почву. Например известью.
3) Если с кислотностью все в порядке то растение стоит подкармить кальцием. Например удобрением Calcium Magnesium от GHE. https://growrow.ru/calmagghe
Так же это может быть гниль.
Дайте растению гуминовых кислот. Например Diamond Nectar https://growrow.ru/diamondnectarghe или Фульвогумат Иван Овсинский https://growrow.ru/ivanovsinsky. Удобрение на основе Гуминовых кислот повышают усваиваемость питательных элементов, усиливают иммунитет растения к грибковым заболеваниям и гнили, делает растение стрессоустойчивым к неблагоприятному климату. Применение гуминовых кислот не только даст Вам здоровое растение, но и повысит урожай до 30 - 35 %.