Первый
Не совсем раскрыт вопрос. Имелось ввиду отдельные от смет на строительно-монтажные работы или проектные работы? Если так, то ответ прост: для этих видов работ используются разные сметные расценки. И просто невозможно осметить изыскательские работы например по ФЕР-2001 или ТСН-2001. Для этого есть СБЦ - сборники базовых цен для всей территории РФ и МРР методические рекомендации для г. Москва.
Тут кажется ответ довольно очевидным. Составлять отдельные сметы на изыскательские работы следует потому что это отдельный вид работ, исполнителем которых является отдельная организация, которая имеет собственные расценки на услуги.