Думаю, всё довольно просто. Риск заболеть вирусом гриппа или ОРВИ зависит от состояния нашей иммунной системы, работоспособность которой зависит от множества факторов.
Осенью люди часто мёрзнут по причине резкой перемены погоды(похолодания), отсутствия отопления в помещениях для работы/учёбы. Это обстоятельство влияет на состояние организма в целом и иммунной системы в частности. Таким образом, холод, ветер воздействуют на наш организм и понижают эффективность работы иммунной системы(и не только).
Различные вирусы всегда присутствуют в окружающем нас пространстве и нашем организме. Но в благоприятных условиях наша иммунная система справляется с ними, активно синтезируя и вырабатывая антитела. Но в периоды холода и резких перепадов температур этот процесс может нарушаться и мы становимся подвержены воздействию вирусов, что приводит к неспособности защитной системы нашего организма адекватно бороться с внешними агентами. Это обстоятельство и приводит к повышению заболеваемости в этот сезон.