Возможно я неправильно идентифицировал источник, из которого Вы вывели эту мысль: но думаю, что речь идет о принятии рядом штатов США т.н. "Законов о религиозной свободе", дающим право частным предприятиям в США отказывать в обслуживании гей-пар вследствие религиозных взглядов владельца.
Так вот, в данном случае противоречия, как такового, нет. Верховный Суд США (суд федерального уровня) принял решение, согласно которому однополые браки становятся легальны на всей территории страны. Губернаторы наиболее консервативных штатов (на момент принятия решения суда чуть меньше трети штатов не признавали однополые браки ни под каким соусом), не имея возможности перечить, все же предприняли ряд шагов, которые должны "сгладить последствия" для болезненно воспринявших эту новость практикующих христиан. Это разные уровни государственной власти.
Потому что и геи и гомофобы - это в первую очередь люди. И права имеют равные. И до тех пор, пока ни не совершают действий, как либо нарушающих права других людей, они свободны в своих мыслях и сексуальных предпочтениях.
Американская демократия предполагает поддержку любых меньшинств. Они имеют право иметь и высказывать свое мнение, но при этом не должны нарушать законы США.
Потому, что современное общество ставит своей задачей не защиту прав каких-то определенных групп людей, а защиту права всех без исключения граждан на собственное мнение и возможность его отстаивать любыми законными средствами.