Ну во-первых, он не так уж плохо изучен, если сравнить с тем, что о нем было известно каких-то 40-50 лет назад. Наука о мозге за последние десятилетия шагнула вперед значительно, особенно с экспоненциальным ростом вычислительных мощностей и развитием информационных технологий и электроники.
Во-вторых, необходимое условие для изучения какого-либо объекта - чтобы этот объект был проще и примитивнее средства его изучения. Самое мощное средство нашего познания - наш собственный мозг, почти все остальное в известной нам вселенной устроено проще. А вот с самим мозгом это условие перестает выполняться.