Причин может быть много. Например, кошка выросла и лоток стал маленьким или неудобным. Или не нравится наполнитель, если его меняли. Либо лоток вымыт недостаточно хорошо (кошлки очень хорошо чувствуют запахи). Также кошке может не нравится местоположение лотка. Например, ее кто-то напугал, когда она ходила в туалет, и теперь кошка боится ходить в лоток снова. Разобраться в причинах можно, если перебирать последовательно все возможные варианты и смотреть, как менятеся поведение кошки. Также можно обратиться к зоопсихологу.
У кошки очень хорошее обоняние и во многом они ориентируются по запаху. Так коты определяют и метят территорию. А с лотком на много проще. Стоит один раз помыть лоток моющим средством, которое сильно источает запах отпугивающий кошку (например хлорка) и она перестанет ходить в этот лоток. Лучше лоток мыть водой и использовать освежитель воздуха. Бывают случаи, когда кошка случайно сходила мимо лотка ( сидела на лотке, но промазала, только в этом случае), нельзя ругать и тыкать носом, а то она потом не будет ходить на лоток, думая, что её поругали за это. Есть кошки, которые не ходят в грязный лоток (мой кот такой, в уже использованный лоток не ходит, просит убрать, а кошке плевать, ходит в грязный).