Бог допустил разделение Церкви всё по той же причине что и раньше когда допустил падение Адама, разделение Своего народа Израиля, отпадение Израиля, ожесточение Израиля и т.д. Бог не может насильно удерживать людей в союзе, в котором они быть не хотят. И потом, иногда просто необходимо дать людям того чего они хотят, чтобы они на своем опыте увидели плоды такого положения и возможно на этом опыте получили "эмпирический" урок.
К Единству не простой путь - путь через множество сложностей, вариаций и т.д. Возьмите семью - союз мужчины и женщины, двух прямопротивоположных субьекта, у которых и мышление устроено по разному и видение, и функционал, и физиология и т.д. Как добиться здесь единства? Уж конечно не путем уничтожения уникальных свойств одного в угоду другого - когда мужчина хочет сделать женщину продолжением самого себя или наоборот. А каким же путем можно это соединить? Путем любви, взаимоуважения, взаимопомощи, развитие своих уникальных черт характера и обтачивания шероховатостей друг об друга. Вот так и Бог допустил разные формы выражения веры, которые в принципе должны дополнять друг друга. Попытка устроить единство другим и более простым путем приводит к диктату, тоталитаризму, авторитаризму, когда единство достигается не на основе кооперации, а на основе делания всех под одну копирку.
еще про метафоричность Писания