Тут уже ответили по делу Юкоса, поэтому я выскажу свои 5 копеек непосредственно по фигуре Ходорковского в более широком смысле.
ФБК не будет проводить никаких расследований по Ходорковскому, потому что:
1) Ходорковский заявляет примерно ту же идеологическую платформу, что и Навальный, являясь сторонником демократических реформ. Смысла копать под тактического союзника в противостоянии с режимом нет никакого.
2) Несмотря на своё прошлое, Ходорковский является чуть ли не единственным олигархом, считающим необходимой определенную корректировку итогов приватизации, которая по его мнению была несправедливой. Навальному же приходится базировать свой политический капитал именно на борьбе с нынешней неофеодальной клептократией, оформившейся в результате охранительства итогов приватизации. В связи с этим разумным опять же представляется союз с Ходорковским, который не слишком-то компрометирует Навального по причине их схожего отношения к 90-ым и итогам приватизации
3) Навальному не нужен слишком крепкий союз с Ходорковским, поскольку он является самостоятельным политиком, который при более свободной политической системе мог бы оказаться по ряду вопросов в оппозиции к Ходорковскому. Поэтому и в чрезмерном укреплении позиций МБХ Навальный не заинтересован