Вероятно, такое может наблюдаться потому, что когда человек только ложится спать, его мозг и весь организм переходят от режима бодрствования к режиму сна. Изменяется характер нервных процессов, обменных и т.д. На это часто требуется какое-то время. А когда человек уже находится в состоянии сна, и оказывается вырван из него будильником, ему довольно легко уснуть снова потому, что большей частью он всё ещё в режиме сна, хотя сознание и включилось. Обмен веществ ещё работает как у спящего, мозг проснулся не полностью и задействовал не все свои функции, которые он использует при бодрствовании. Бывают исключения. Например, организм вырабатывает привычку сам просыпаться в нужное время, иногда даже чуть-чуть раньше будильника. Или же, если проснувшись по будильнику сразу вспомнить о каком-то тревожном или радостном событии, ожидающем в этот день, это может вызвать в организме выделение стимулирующих веществ, что быстро прогонит сон.