Почему большое количество галактик называют NGC ,а далее числовая комбинация?

NGC - это аббревиатура, обозначающая New General Catalogue. Как нетрудно догадаться, это каталог космических объектов: "туманностей" и скоплений. Почему "туманностей" в кавычках? Потому что в 1880-х, когда этот каталог впервые был собран, люди не очень-то понимали, что из себя представляют эти туманности (также как и в случае каталога Мессье)*. Многие из них, в частности, оказались галактиками, а не остатками сверхновых или постзвёздными туманностями. 

Каталог несколько раз обновлялся: в начале 20 века (IC = Index Catalogue), в 70-х (RNGC = Revised New General Catalogue), в 90-х (NGC/IC) и в 2009 (RNGC/IC = Revised New General Catalogue and Index Catalogue). Новые объекты, включённые в обновлённые каталоги всё так же называется с префиксом NGC (далее - порядковый номер) либо IC.

• На самом деле, до 60-70-х годов (не смотря на то, что уже было понятно что такое другая галактика) в статьях очень часто встречается термин nebula (т.е. туманность) вместо galaxy. 

Вот вам пример из 70-х - эпохальная статья Веры Рубин и Кента Форда про вращение звёзд в галактике Андромеда (или как они называют Andromeda Nebula). Эта статья, кстати, одно из первых прямых подтверждений существования тёмной материи.