Что вы понимаете под Богом и тем что он создал людей и дал им волю? Я так понимаю под ним вы имеете в виду библейского Бога. Тогда ответ очевиден, его пути неисповедимы и раз он так сделал значит так было нужно и вы не должны сомневаться в его мудрости и правильности его поступков.
С позиции например буддизма люди изначально появляются со свободной волей, являясь перерождением существ с высших миров. Соответственно там нет проблемы почему люди не созданы умными на столько что бы не совершать злых поступков.
Если же смотреть с точки зрения современной науки, то люди появились в результате эволюции и существует множество причин почему люди совершают злые поступки начиная от эгоистических побуждений заканчивая проблемами в психике.