Вопрос подразумевает, что его сперва не было, а потом он каким-то образом "взялся". Откуда такое предположение? Логичнее думать, что водород на Земле появился вместе с самой Землей. И не только на Земле. Он просто существует во вселенной, как часть вселенной. Земля тоже часть вселенной.