При гриппе, как и при других инфекционных заболеваниях, в организме происходит размножение вирусов, микроорганизмов. При лечении и работе иммунной системы происходит их массовая гибель. Но трупы этих микробов никуда не исчезают, а разлагаются иммунными клетками нашего организма с выделением токсинов. Данные токсины вызывают симптомы так называемого "интоксикационного синдрома", что проявляется: головной болью, слабостью, тошнотой, болью в мышцах, суставах, чувством разбитости.
Именно болевые ощущения возникают по причине того, что эти токсины раздражают специальные болевые рецепторы (ноцицепторы), расположенные в мышцах и костях. Это и вызывает ощущение ломоты в костях, суставах, мышцах.