Тут могут быть две причины: ошибки файловой системы или физическое повреждение секторов диска.
Первая устраняется запуском утилиты check disk. В свойствах логического раздела во вкладке Сервис есть пункт Проверка диска на наличие ошибок файловой системы. Нажмите проверить. Или из командной строки (запуск от имени администратора) набирается команда chkdsk /f /r и нажимается клавиша Enter. После перезагрузки будет произведено сканирование диска на наличие повреждённых секторов и их автоматическое исправление.
Если ошибки считывания секторов вызваны повреждением жёсткого диска, то исправить их полностью не получится. Множественные физические повреждения секторов жёсткого диска говорят о скором выходе его из строя. Проверить жёсткий диск на сбойные сектора можно утилитой Victoria. Она отсканирует диск и создаст карту повреждённых секторов (бэд-блоков). По их количеству и месторасположению можно судить о степени износа устройства. С помощью Виктории можно попробовать восстановить бэд-блоки функцией Advanced Remap или произвести перезапись/стирание повреждённых секторов. Логические ошибки исправляются, физические повреждения исправляются далеко не всегда. Когда сбойных или очень медленных секторов много, то готовьтесь к скорому краху системы. Пока не поздно спасайте с этого диска важные данные.
Если обнаруженные повреждённые сектора находятся в начале системного диска, то это будет причиной постоянных сбоев загрузки и зависаний системы. Если повреждённые сектора находятся в конце дискового пространства или, хотя бы, в середине, их можно программно "отрезать" от остального дискового пространства с помощью той же Виктории. Естественно, используемое дисковое пространство уменьшится и вся информация с отрезанной части будет недоступна.