Добрый день!
Если женщина работает в гос.учреждении (да и в любом другом), такого просто не может быть, у "госов" в этом плане всегда все четко.
Может быть она работает на половину ставки? В этом случае допускается выплата зарплаты, согласно отработанному времени - то есть половина от оклада.
Посмотрите расчетный лист, слева суммы начислений, справа суммы выплат. Нужно учесть, что вычитается 13% НДФЛ.