Можно ли в 64-разрядной Винде запустить батник из 32-разрядного приложения, но так, чтобы этот батник выполнялся как 64-разрядная задача?

Батник это батник, интерпретируемый отдельной программой cmd. При запуске командой system или аналогом из любого приложения (х32/х64) - открывается отдельное приложение cmd, той разрядности, которой он предоставлен в системе: если система 32-разрядная - запустится 32-разрядный интерпретатор, если система 64-разрядная - запустится 64-разрядный. Приложение, из которого вы запускаете - не имеет значения.