Можно ли самозанятому продавать стаканы, которые сам заматировал?

Да, можно. Одним из допустимых видов деятельности для самозанятых является торговля продукцией собственного производства (https://npd.nalog.ru/).
В данном случае стакан, еще не подвергшийся матированию, является приобретенным полуфабрикатом для производства продукции, а матовый стакан будет иметь статус готовой продукции.