Да можно. Вы можете воспользоваться сперва вычетом по квартире, а затем по процентам.
Но обычно в декларации указывают оба вычета одновременно. То есть вписывают в декларацию и расходы на покупку квартиры (но не более 2 млн.) и расходы на уплату процентов (но не более 3 млн.). Затем сумму недоиспользованного вычета переносят на следующие и все последующие годы до момента ее полного использования.
При этом из года в год сумма вычета по процентам может увеличиваться. Но в пределах 3 млн. руб.
2 эксперта согласны
Да, так обычно и делается. Сначала делаете возврат за покупку квартиры, а потом за выплаченные проценты.
Помогу заполнить 3-НДФЛ удаленно по всей России. Все вычеты, любой сложности. 
Перейти на taplink.cc/natashasemkina2017
Здравствуйте, можно, 2 млн (13%) основной вычет, 3 млн (13%) по процентам. Подробнее - ст. 220 Налогового кодекса РФ или информация на сайте ФНС РФ (ссылка).