При регистрации ИП, как указано в законе, физическое лицо должно указать свой адрес места жительства, т.е. постоянную прописку в паспорте.
При наличии у физического лица постоянной прописки и временной регистрации документы примут только в налоговой по адресу прописки.
Если штампа по прописке в паспорте нет, возможна регистрация ИП по месту пребывания, т.е. временной регистрации