Можно ли по Шенгенской визе, открытой в Литву/Латвию, поехать в Венгрию, например, через Польшу?

Можно, если по итогам действия визы количество дней, проведённых в стране, открывшей визу будет больше, чем в остальных странах Шенгена вместе взятых.
"Правило первого въезда" отменили, но при первом въезде в страну, отличную от той, которая выдала визу могут быть дополнительные вопросы по маршруту поездки.