Можно ли не платить налоги за ИП за период нахождения в местах лишения свободы?

Вы про налоги или СТРАХОВЫЕ ВЗНОСЫ?

Называйте вещи своими именами.

В заключении от налогов не спрячешься, а взносы можно и не платить - суды на стороне ИП.