Наложить обременение на помещение возможно при помощи залога, которым и будет обеспечен договор займа.
Залогодателем будет общество в лице директора, залогодержателем- директор как физическое лицо. Собственно говоря, также, как и при заключении договора займа.
Поскольку это сделка с заинтересованность директора и, возможно, крупная (более 25% активов общества), то её нужно одобрить решением участников по правилам ст. 45,ст.46 ФЗ об ООО.
Поскольку залог осуществляется в отношение недвижимого имущества, его нужно будет зарегистрировать в росреестре. Заявления от обоих сторон подаст также директор как руководитель общества и как физическое лицо. Либо это сделает представитель (представители) по доверенности, заверенный нотариально.