Нет, NTFS (формат Windows) не поддерживается устройствами Apple напрямую, соответственно использовать в Time Machine диски отформатировны в NTFS нельзя. Mac OS Extended (журнальный) и форматы Xsan подходят для этого.
а если я переформатирую в apfs или hfs+, но оставлю файлы на диске?